並非所有的先天性心臟病童都會在出生時或小時候就被小兒科醫師診斷發現,常常到了上小學時,上體育課等等活動體能遠不如其他小朋友時才被重視;在過去,也曾發生,小朋友在運動中發生猝死的現象;為了避免這樣的憾事發生以及早期發現診斷罹患先天性心臟病童,基金會從民國78年開始就以抽樣的方式在台灣多個縣市為學生做心臟病篩檢,透過問卷調查、技術員為學生做心音圖及心電圖檢查、醫師到學校為疑似心臟病學童聽診,並將須要進一步檢查的學生轉診到醫學中心做檢查,並為有心臟病的學童做適當的治療或門診追蹤,同時,也通知家長及學校老師學童的活動準則。自民國78年以來,心臟病篩檢團隊的足跡踏遍了台灣各個縣市,為百萬名學童做心臟病篩檢,早期發現,早期治療。